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L’algorithme du plaisir

Julien CLÉMENT

37 ans, Chargé de recherche

Groupe de Recherche en Informatique, Image, Automatique et Instrumentation de Caen (GREYC)

CNRS/Université de Caen Basse-Normandie/ENSICAEN

Mon plaisir, c’est réfléchir.

Je travaille en analyse d'algorithmes. Un algorithme n'est rien d'autre qu'une recette qu'un ordinateur applique. Les méthodes sont souvent mathématiques. Il s'agit d'étudier les algorithmes et leur performance, plus précisément d'évaluer leur coût en terme de ressources: temps, espace mémoire, … Cela permet de prédire leurs comportements et de les améliorer. Ces algorithmes peuvent se retrouver dans des domaines divers comme la cryptologie, la bioinformatique, … Prenons un génome*. Je me suis intéressé au problème de la sous- ou sur-représentation de motifs dans le génome, en regardant les séquences d’ADN. Des motifs particuliers y apparaissent, qui ont souvent une fonction biologique. Quels sont-ils, quelle est leur fréquence, leur distribution ? On observe un comportement, on l’explique à l’aide de modèles que l’on construit et que l’on teste. Mon plaisir, c'est réfléchir, avancer dans l’explication d’un phénomène, en espérant apporter un autre point de vue ou une meilleure compréhension.

Génome : Ensemble de l’ ADN présent dans le noyau de chacune des cellules d’un organisme. Notre génome est une chaîne de 3,4 milliards de perles. Les génomes de deux personnes diffèrent en moyenne d’une "perle" sur mille.

Droit images : F.CASTEL

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